Границы поселения установлены законом Вологодской области от 6 декабря 2004 года № 1107-ОЗ «Об установлении границ Белозерского муниципального района, границах и статусе муниципальных образований, входящих в его состав».
Куностьское сельское поселение включает в себя 4 населенных пункта.
Административный центр — поселок Нижняя Мондома.